- Program Pendidkan Khas Integrasi (Pembelajaran) SK Batu Gajah telah dibuka pada tahun 2004 oleh Cik Hjh Khadijah binti Hj Jusin. Ini adalah disebabkan program yang sedia yang ada agak jauh dari kediaman murid.
- Pada tahun pertama operasi,bilangan muridnya ialah 7 orang. Dengan menumpang bilik bahan bantu mengajar, keadaan menjadi begitu sesak.
- Menyedari kesesakan ini, Jabatan Pelajaran Melaka telah membina bilik yang agak lengkap dengan kemudahan bilik darjah, dapur dan tandas.
- Bilangan murid semakin bertambah dari tahun ke setahun menjadi 19 orang pada tahun 2011. Pada tahun 2011, PPKI menerima seorang GPK Pen.Khas iaitu Pn Hjh Zaiton binti Mohammad disamping 7 orang guru dan 2 orang PPM.
- Murid-murid PPKI SK Batu Gajah sering aktif menyertai setiap aktiviti yang dianjurkan oleh pihak sekolah dan Unit Pendidikan Khas. Akhir kata diharapkan PPKI SKBG cemerlang dari pelbagai aspek yang mana membantu murid-murid berkeperluaan khas ini
